网易云课堂《医学方-科研系列课程》

01-GEO、TCGA、Oncomine数据挖掘教程

数据挖掘代码

课时1 数据挖掘概述.mp4 188.52M

课时10 TCGA数据整理和基因注释.avi 212.45M

课时11 寻找差异基因和制作5年生存率.avi 340.84M

课时12 Oncomine概述及Meta分析.avi 165.33M

课时13 Oncomine之差异分析及共表达分析.avi 241.99M

课时14 非cel格式GEO芯片数据分析.mp4 49.25M

课时2 GEO在线工具的应用.avi 453.44M

课时3 GEO数据下载和数据质量分析.avi 124.10M

课时4 原始数据预处理.avi 193.68M

课时5 寻找差异基因及制作热图和火山图.avi 287.24M

课时6 富集分析.avi 268.23M

课时7 KEGG分析.avi 221.56M

课时8 蛋白互作网络.avi 215.52M

课时9 TCGA数据下载.avi 202.76M

02-MIMIC临床数据使用入门

MIMIC临床数据库使用入门 – 课时1-3.mp4 653.41M

MIMIC临床数据库使用入门 – 课时4-5.mp4 517.14M

SQL QUERY.docx 20.09kb

03 R语言可视化及绘图

10、10.几何对象之点图.mp4 200.34M

11、11.几何对象之条图.mp4 151.29M

12、12.几何对象之盒形图和直方图.mp4 183.43M

13、13.几何对象之线图.mp4 209.92M

14、14.几何对象之标签绘制.mp4 159.91M

15、15.坐标轴自定义函数.mp4 250.64M

16、16.图例与标题.mp4 336.04M

17、17.坐标系转换函数与图片分面函数.mp4 203.70M

18、18.主题函数&一页多图&高质量图片导出.mp4 268.03M

19、19.venn图和火山图.mp4 165.35M

1、1.par函数.mp4 372.94M

20、20.nomogram和heatmap.mp4 202.80M

21、21.生存曲线.mp4 136.72M

2、2.散点图&盒形图.mp4 348.12M

3、3.条形图&直方图.mp4 289.30M

4、4.饼图&克利夫兰点图&条件图.mp4 135.72M

5、5.低级绘图函数(1).mp4 148.91M

6、6.低级绘图函数（2）.mp4 207.66M

7、7.图形颜色选取.mp4 125.59M

8、8.ggplot2之qplot.mp4 191.72M

9、9.ggplot2之美学函数.mp4 129.82M

医学方R语言可视化配套代码.pdf 609.25kb

04-R语言与高级医学统计学

1.mp4 43.24M

10.mp4 33.94M

11.mp4 27.33M

12.mp4 69.65M

13.mp4 39.54M

14.mp4 27.70M

15.mp4 41.72M

16.mp4 28.95M

17.mp4 101.69M

18.mp4 49.26M

19.mp4 24.28M

2.mp4 64.55M

20.mp4 34.75M

21.mp4 61.85M

22.mp4 39.28M

23.mp4 72.21M

24.mp4 35.98M

25.mp4 40.63M

26.mp4 34.81M

27.mp4 60.56M

28.mp4 34.96M

29.mp4 34.63M

3.mp4 26.30M

30.mp4 52.54M

31.mp4 54.16M

32.mp4 34.73M

33.mp4 55.90M

4.mp4 45.85M

5.mp4 54.24M

6.mp4 75.73M

7.mp4 60.51M

8.mp4 30.01M

9.mp4 44.91M

05-豪斯医生数据挖掘之WGCNA详解

ClinicalTraits.txt 7.29kb

epr.txt 32.77M

课时01.使用cytoscape寻找核心基因.MP4 154.85M

课时02.WGCNA理论和算法1.mp4 198.80M

课时03.WGCNA理论和算法2.mp4 344.12M

课时04.WGCNA理论和算法3.mp4 156.68M

课时05.WGCNA理论和算法4.mp4 141.83M

课时06.输入文件准备.mp4 349.12M

课时07.寻找基因模块.mp4 245.05M

课时08.与临床信息相结合.mp4 357.64M

课时09.确定核心基因.mp4 299.69M

医学方豪斯医生WGCNA配套代码.pdf 126.18kb

06-数据挖掘—miRNA调节网络的构建

01、TCGA概述

02、构建调控关系理论

03、WGCNA理论

04、数据下载

05、提取蛋白编码基因

06、差异分析

07、基于算法构建调控

08、cytoscape构建网络

09、数据库预测

医学方miRNA调节网络的构建配套代码

07.医学方医学数据挖掘精品课程-手把手教您如何数据挖掘

10.TCGA数据整理和基因注释.mp4 347.76M

11.寻找差异基因和制作5年生存率.mp4 592.51M

12.Oncomine概述及Meta分析.mp4 323.72M

13.Oncomine之差异分析及共表达分析.mp4 401.46M

1数据挖掘概述.mp4 193.54M

2.GEO在线工具的应用.mp4 300.16M

3.GEO数据下载和数据质量分析.mp4 230.52M

4.原始数据预处理.mp4 350.56M

5.寻找差异基因及制作热图和火山图.mp4 412.54M

6.GO富集分析.mp4 379.63M

7.KEGG分析(修复).mp4 392.27M

8.蛋白互作网络.mp4 306.82M

9.TCGA数据下载.mp4 335.94M

课程脚本代码.zip 10.02kb

08-医学R语言快速入门与数据清洗

01.R语言、Rstudio简介.avi 323.01M

02.R包的安装&向量.avi 155.96M

03.数值型&逻辑型向量.avi 175.97M

04.逻辑表达式&字符串向量.avi 104.45M

05.因子型变量.avi 156.56M

06.列表&矩阵.avi 136.66M

07.数组&初识数据框.avi 123.17M

08.数据框.avi 205.85M

09.数据框的基本操作.avi 168.21M

10.条件与循环.avi 132.56M

11.自定义函数&数据读取.avi 219.17M

12.数据的读取与写出.avi 137.69M

13.数据排序与长宽型数据转换.avi 189.06M

14.变量的因子化.avi 109.77M

15.apply函数家族.avi 94.40M

16.数据汇总函数.avi 140.85M

17.plyr包.avi 200.95M

18.dplyr包.avi 153.06M

19.data.table包.avi 142.52M

20.缺失值的识别与处理（1）.avi 132.71M

21.缺失值的识别与处理（2）.avi 168.90M

22.异常值和重复值的处理.avi 169.49M

23.字符串的处理.avi 219.37M

24.正则表达式.avi 163.93M

25.stringr & stringi包.avi 213.38M

26.时间与日期数据的处理.avi 254.77M

27.lubridate包.avi 202.32M

28.时间序列简介.avi 103.38M

29.时间序列分析.avi 142.97M

30.描述性统计.avi 156.57M

31.t检验.avi 107.62M

32.数据变换.avi 101.40M

33.方差分析.avi 194.05M

34.卡方检验.avi 108.91M

35.回归分析与模型诊断.avi 211.16M

36.模型诊断与Logistic回归.avi 118.25M

37.生存分析与COX回归.avi 112.36M

R CODES.rtf 130.46kb